O Núcleo de Estudos Rurais e Urbanos (NERU) é um grupo interdisciplinar voltado para o desenvolvimento de atividades de ensino, pesquisa e extensão envolvendo temas de educação, dinâmicas econômicas, sócio-espaciais no rural e no urbano em suas interfaces, interações e conflitos. Um dos princípios norteadores do NERU é a indissociabilidade entre ensino, pesquisa e extensão, entendida como potencializadora da capacidade institucional da Universidade em promover sinergia e aprendizagem fundado nestas três atividades-fins.
As atividades de ensino, os projetos de pesquisa e extensão são desenvolvidos tanto no âmbito da Instituição como em parceria com outras IES, em particular a Universidade Estadual do Norte Fluminense (UENF), com a Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (CPDA/UFFRJ) e a Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ). O Núcleo também desenvolve parcerias com instituições e entidades técnicas como cooperativas de assistência técnica e extensão rural, comitês e colegiados locais, com os movimentos sociais e, entidades de classe (AGB – Associação de Geógrafos Brasileiros), bem como com outros Núcleos de Pesquisadentre estes, o Núcleo de Estudos SocioAmbientais (NESA/UFF), o Grupo de Pesquisa Território e Cidade (UFF), o Núcleo de Estudos de Economia Aplica (NEEA), o Núcleo de Estudos e Pesquisas em Teoria Social (NEPETS), Núcleo de Estudos EM Economia Política e Geográfica (NEEPEG)